Dabei handelt es sich um den Prozess der Erfindung neuer Medikamente zur Behandlung von Krankheiten auf der Grundlage der Kenntnis biologischer Angriffsziele. Es wird auch als rationales Arzneimitteldesign bezeichnet. Es dient dem therapeutischen Nutzen des Patienten. Arzneimitteldesign ist ein großartiger erfinderischer Prozess zur Entwicklung neuer Medikamente auf der Grundlage eines biologischen Ziels. Es wird auch als rationales Medikamentendesign oder rationales Design bezeichnet. Das ist die Erfindung der Medizingeschichte, um eine signifikante therapeutische Reaktion zu erzielen. Das Medikament ist ein organisches Molekül. Wenn es an die Zielstelle gebunden wird, kann es die Funktion eines Biomoleküls entweder hemmen oder aktivieren, was zu einem therapeutischen Nutzen führt. Beim Arzneimitteldesign geht es darum, solche Moleküle zu entwerfen, die in Form und Ladung der biomolekularen Zielstelle ähneln, um an diese zu binden. Das Arzneimitteldesign basiert auf der Kenntnis der dreidimensionalen Struktur bimolekularer Ziele. Strukturbasiertes Arzneimitteldesign ist der Prozess des Entwurfs einer chemischen Struktur mit dem Ziel, eine Verbindung zu identifizieren, die für klinische Tests geeignet ist. Der Prozess beinhaltet die Art und Weise, wie sich das Gewebe formt und auflädt, um mit dem biologischen Ziel zu interagieren und so eine therapeutische Aktivität zu erzielen. Strukturbasiertes Arzneimitteldesign basiert ausschließlich auf dreidimensionalen Strukturen.