Ein metabolisches Netzwerk chemischer Reaktionen im Genommaßstab, das in einem lebenden Organismus abläuft, wird in erster Linie aus den in seinem Genom vorhandenen Informationen rekonstruiert und umfasst Schritte wie die funktionelle Annotation des Genoms, die Identifizierung der damit verbundenen Reaktionen und die Bestimmung ihrer Stöchiometrie. Zuordnung der Lokalisierung, Bestimmung der Biomassezusammensetzung, Abschätzung des Energiebedarfs und Definition von Modellbeschränkungen. Diese Informationen können in ein stöchiometrisches Stoffwechselmodell integriert werden, das für eine detaillierte Analyse des Stoffwechselpotenzials des Organismus mithilfe von Constraint-basierten Modellierungsansätzen verwendet werden kann und daher für das Verständnis seiner Stoffwechselfähigkeiten wertvoll ist.
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