Pflanzenmikroben können nützlich sein, oder schädliche Mikroorganismen sind für ihr Wachstum und Überleben auf Pflanzen angewiesen. In Pflanzen kommen pathogene, symbiotische und assoziative Interaktionen vor. Für die Stresstoleranz, Krankheitsresistenz und Pflanzenproduktivität sind effiziente und vorteilhafte Wechselwirkungen zwischen Pflanzen und Mikroben erforderlich. Die Isolationscharakterisierung potenzieller Pflanzenmikroben ist für die biologische Bekämpfung verschiedener Pflanzenkrankheiten erforderlich.
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