Die Pflanzenproteomik befasst sich mit dem gesamten Proteinspektrum von Pflanzen, einschließlich der an einem bestimmten Satz von Proteinen vorgenommenen Modifikationen. Proteomik ist eine eingehende Untersuchung eines bestimmten Proteoms, einschließlich Informationen über Proteine und ihre Modifikationen und Variationen. Proteomics arbeitet mit den damit verbundenen Interaktionspartnern und Mitgliedern in einem sequentiellen Netzwerk.