Zeitschrift für Pflanzenphysiologie und Pathologie

Leitfaden zur Gestaltung artspezifischer Primer

Charan Nadipineni

Um die Erregerstämme zu identifizieren, zu charakterisieren und zu unterscheiden, wurde eine PCR-basierte Technik entwickelt. Bei dieser Methode müssen artspezifische Primer entwickelt werden, mit denen wir feststellen können, ob ein bestimmter Erregerstamm in einer Gruppe vorhanden ist oder nicht. Um solche Primer zu entwickeln, benötigen wir Sequenzen der verwandten Arten. Alle diese Sequenzen werden ausgerichtet und ein einzigartiger SNP, der eine bestimmte Art vom Rest unterscheidet, wird zum Entwerfen eines spezifischen Primers verwendet. Zu diesem Zweck wurde ein Protokoll entwickelt; durch Befolgen dieses Protokolls können Forscher ihren gewünschten Stamm leicht identifizieren und ihn für Zuchtzwecke verwenden.

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