Zeitschrift für Pflanzenphysiologie und Pathologie

Entwicklung und Validierung von EST-SSR-Markern in Gymnema sylvestre R.Br.

Kuldeepsingh A. Kalariya, Lipi Poojara, Dipal Minipara, Parmeshwar Lal Saran, Ram Prasnna Meena, Sinora Macwan, Ponnuchamy Manivel

Das für seine antidiabetischen Eigenschaften bekannte Gymnema sylvestre aus der Familie der Asclepiadaceae ist in den Wäldern Südindiens heimisch. Es kommt auch in tropischen Teilen Afrikas und in Australien vor. Alle oberen Teile dieser Pflanze enthalten Alkaloide, Flavone und Saponine, aber die Blätter werden hauptsächlich wegen ihrer medizinischen Eigenschaften verwendet. Die Diversität basierend auf morphologischen, anatomischen und Chemoprofilen und Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD)- und Inter Simple Sequence Repeats (ISSR)-Markern wurde beschrieben, jedoch fehlt bei dieser Pflanze die genetische Diversität auf molekularer Ebene durch die effizientesten, die Expressed Sequence Tags-SSR (EST-SSR)-Marker. Im Rahmen dieser Studie wurden umfangreiche Transkriptomdaten generiert und 5276 SSR-Loci identifiziert. Die Häufigkeit der SSRs in Gymnema sylvestre betrug 1/12,16 kB. Die AAG/CTT-Wiederholungen waren fast zehnmal höher als die CCG/CGG-Wiederholungen. Insgesamt wurden 40 Primerpaare synthetisiert und 27 Primer ergaben eine polymorphe Amplifikation in 25 Genotypen von G. sylvestre , die in verschiedenen Teilen Indiens gesammelt wurden. Die Genotypen DGS 16 und DGS 34 waren die unähnlichsten Genotypen. Dies war die erste Studie, die genetische Vielfalt und hohe Polymorphismen in G. sylvestre mit Hilfe von EST-SSR-Markern mit einer höheren Übertragungsrate von 67,5 % aufdeckte. Es wurde über die ungeordnete Verteilung von Genotypen gleichen Zustands in verschiedenen Clustern berichtet, was daran liegen könnte, dass G. sylvestre eine wichtige Heilpflanze ist, die die Menschen seit der Antike verwenden, und man geht davon aus, dass sie an verschiedene Orte migriert ist.