Limnologie ist die Untersuchung der strukturellen und funktionellen Zusammenhänge von Organismen in Binnengewässern – Seen (sowohl Süßwasser als auch Salzwasser), Stauseen, Flüssen, Bächen, Feuchtgebieten und Grundwasser, während ihre dynamischen physikalischen, chemischen und biotischen Umgebungen sie beeinflussen.
Die limnologische Disziplin integriert die funktionalen Beziehungen von Wachstum, Anpassung, Nährstoffkreisläufen und biologischer Produktivität mit der Artenzusammensetzung und beschreibt und bewertet, wie physikalische, chemische und biologische Umgebungen diese Beziehungen regulieren.
Das Wort Limnologie leitet sich vom griechischen limne – Sumpf, Teich und dem lateinischen limnaea – einem Sumpfgebiet ab.
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